В центре сюжета находится учёный Фауст, который погружён в глубокие раздумья о природе познания. Проведя эксперименты на человеческом теле, он приходит к шокирующему выводу — душа отсутствует. В это время его друг Вагнер, испытывающий чувства унижения, стремится создать идеальное существо в лабораторных условиях — гомункулуса, используя для этого методики, которые вызывают множество вопросов о морали и этике научных экспериментов.